Struktur organisasi institusi STOK Bina Guna memberikan kedudukan pada Lembaga Penjaminan Mutu (LPM) untuk menjalankan SPMI langsung berkoordinasi dengan Ketua STOK Bina Guna dengan melaksanakan manajemen PPEPP (Penetapan, Pelaksanaan, Evaluasi, Pengendalian, dan Peningkatan) yang merupakan kontrol mutu dalam rangka pelaksanaan SPMI pada Program Studi untuk aspek Akademik, pengawasan pada pelaksanaan tugas pokok Wakil Ketua I, Wakil Ketua II, dan Wakil Ketua III, kemudian pada LPPM untuk pelaksanaan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat yang memiliki hubungan koordinasi juga dengan Program studi.  Kebijakan SPMI mencakup semua aspek penyelenggaraan pendidikan tinggi pada STOK BINA GUNA dengan fokus utama pada aspek pembelajaran, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat, serta aspek lain yang mendukung peningkatan mutu institusi. Lingkup kebijakan SPMI akan dikembangkan sehingga mencakup juga aspek lain yang memiliki hubungan dukungan pada kegiatan akademik, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat (Dokumen Kebijakan SPMI).